MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p4

Total Repeats: 2109

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016596	T	6	6	681622	681627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_016596	CGTAC	2	10	681720	681729	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2003	NC_016596	CGGT	2	8	681732	681739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2004	NC_016596	T	6	6	681751	681756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_016596	GCC	2	6	681999	682004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_016596	CTT	3	9	682021	682029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_016596	CGG	2	6	683601	683606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_016596	GGCC	3	12	683671	683682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_016596	GGCGCG	2	12	683686	683697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_016596	CTC	2	6	683716	683721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_016596	GCC	2	6	683746	683751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_016596	GCG	2	6	683768	683773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_016596	CCT	2	6	683889	683894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_016596	CGG	2	6	683898	683903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_016596	AGC	2	6	683931	683936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_016596	AGC	2	6	683975	683980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_016596	CGG	3	9	683991	683999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_016596	GCG	2	6	684049	684054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_016596	CGT	2	6	684114	684119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_016596	TGG	2	6	684177	684182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_016596	CGG	2	6	684184	684189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_016596	GGC	2	6	684208	684213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_016596	C	6	6	684287	684292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2024	NC_016596	GGCGT	2	10	684293	684302	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2025	NC_016596	CTC	2	6	684337	684342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2026	NC_016596	AGC	2	6	684392	684397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_016596	GCC	2	6	684431	684436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2028	NC_016596	AGC	2	6	684438	684443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_016596	GGC	2	6	684545	684550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_016596	CGGG	2	8	684726	684733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2031	NC_016596	CGG	2	6	684734	684739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_016596	CCG	2	6	684746	684751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2033	NC_016596	CCA	2	6	684755	684760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2034	NC_016596	TCC	2	6	684766	684771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2035	NC_016596	GCA	2	6	684773	684778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_016596	GAC	2	6	684783	684788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_016596	CGGC	2	8	684799	684806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2038	NC_016596	CCAC	2	8	684869	684876	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2039	NC_016596	GCC	2	6	684885	684890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2040	NC_016596	CCT	2	6	684911	684916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2041	NC_016596	ATC	2	6	684967	684972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_016596	CTG	2	6	684984	684989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_016596	CGGCG	2	10	685005	685014	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2044	NC_016596	TGG	2	6	685016	685021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_016596	CAT	2	6	685086	685091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2046	NC_016596	GGC	2	6	685092	685097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_016596	GGCG	2	8	685109	685116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2048	NC_016596	CGA	2	6	685220	685225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_016596	GC	3	6	685249	685254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2050	NC_016596	TCC	2	6	685279	685284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2051	NC_016596	GGC	2	6	685292	685297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_016596	GGCCC	2	10	685299	685308	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2053	NC_016596	CTTT	2	8	685320	685327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2054	NC_016596	CGG	2	6	686288	686293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_016596	CCG	2	6	686299	686304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2056	NC_016596	GTTC	2	8	686310	686317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2057	NC_016596	GGT	2	6	686318	686323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_016596	CCGAT	2	10	686330	686339	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2059	NC_016596	GA	3	6	686350	686355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_016596	TCA	2	6	686392	686397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_016596	CG	3	6	686426	686431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2062	NC_016596	GGC	2	6	687173	687178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_016596	CGAA	2	8	687185	687192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2064	NC_016596	A	6	6	687250	687255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_016596	GCA	2	6	687303	687308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_016596	AC	3	6	687314	687319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2067	NC_016596	ATCG	2	8	687344	687351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2068	NC_016596	A	8	8	687671	687678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_016596	CCG	2	6	687702	687707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2070	NC_016596	T	6	6	687751	687756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_016596	AGC	2	6	687793	687798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2072	NC_016596	TGAG	2	8	688010	688017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_016596	AAT	2	6	688052	688057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_016596	GCG	2	6	688084	688089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_016596	GCG	2	6	688248	688253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2076	NC_016596	TAC	2	6	688499	688504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2077	NC_016596	CCA	2	6	688506	688511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2078	NC_016596	CTG	2	6	688549	688554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2079	NC_016596	CGC	2	6	688572	688577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2080	NC_016596	GC	3	6	688584	688589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2081	NC_016596	AGC	2	6	688610	688615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2082	NC_016596	CAA	2	6	688648	688653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2083	NC_016596	GCA	2	6	688654	688659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_016596	GCA	3	9	688701	688709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2085	NC_016596	GAG	2	6	688717	688722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2086	NC_016596	ATT	2	6	688860	688865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2087	NC_016596	ATC	2	6	688947	688952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2088	NC_016596	GC	3	6	688966	688971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2089	NC_016596	CAA	2	6	688984	688989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_016596	AGCC	2	8	689015	689022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2091	NC_016596	AAGC	2	8	689048	689055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2092	NC_016596	GC	3	6	689062	689067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2093	NC_016596	ATGT	2	8	689184	689191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_016596	GCG	2	6	689243	689248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_016596	CAC	2	6	689274	689279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2096	NC_016596	AGT	2	6	689306	689311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_016596	TCA	2	6	689334	689339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_016596	GAT	2	6	689347	689352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_016596	TGC	3	9	689384	689392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_016596	GAT	2	6	689397	689402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_016596	GC	3	6	689418	689423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2102	NC_016596	CTGA	2	8	689430	689437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2103	NC_016596	TG	3	6	689449	689454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_016596	CAT	2	6	689466	689471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_016596	TGCCG	2	10	690166	690175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2106	NC_016596	GGCC	2	8	690194	690201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2107	NC_016596	GCC	2	6	690207	690212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2108	NC_016596	CGG	2	6	690272	690277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_016596	ATC	2	6	690281	690286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.